השלב המכריע בניתוח כרומטוגרפי של גזים מומסים בשמן שנאים הוא לקחת דגימת שמן, שאמורה להיות מייצגת מספיק. שיטת הדגימה האידיאלית צריכה לעמוד בתנאים הבאים כדי למנוע אובדן של גזים מומסים בשמן.
(1) מזרק הזכוכית המשמש בעל אטימות טובה.
(2) במהלך הדגימה, יש לבודד לחלוטין את האוויר ואל תיתן לאוויר לברוח או לשאוף לאחר הדגימה.
(3) החומר יציב מבחינה כימית ואינו ניזוק בקלות, מה שמקל על אחסון והובלה.
(4) כאשר לוקחים דגימות שמן, משתמשים בדרך כלל במזרק זכוכית מלא של 100 מ"ל.
(5) לפני הדגימה, נקה וייבש את המזרק ביסודיות. הבוכנה של המזרק אמורה להיות מסוגלת להחליק בחופשיות ללא כל חסימה.
(6) יש לדגום שמן משסתום הדגימה בתחתית הציוד.
(7) יש להסיר ככל האפשר את שאריות השמן בשסתום הדגימה, ולנגב את הלכלוך מסביב לגוף השסתום.
(8) שיטת חיבור הדגימה אמינה, ולמערכת החיבור אין פגמים בדליפת נפט או גז.
(9) לפני הדגימה, יש להשתדל להוציא את האוויר במיכל הדגימה ובמערכת החיבור.
(10) במהלך הדגימה תזרום דגימת השמן לתוך המיכל בצורה חלקה ללא פגיעה, התזה או קצף
(11) לאחר נטילת דגימת השמן, סגור את שסתום ניקוז השמן, הסר את המזרק, אטום את הפתח, תיוג אותו ובצע ניתוח כרומטוגרפי בהקדם האפשרי.
